NCBI中预测蛋白质结构域中Specific hit 是什么意思

序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析,motif分析和功能预测等,结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构,二级结构目前预测还是比较准确的,三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swiss

据我所知ncbi没有相关的功能,毕竟其是以核苷酸序列为主.因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,你可以到swissprot网站,那里有许多相关的服务.例如,计算PI你可以用ComputepI/Mwto

输入该激酶的名字查询蛋白质,就有相应的序列信息.

1NCBIORFfinder2NCBIBlast3看看该SNP所改变的密码子是否和原来的密码子编码同一个氨基酸（从ATG开始,3n）

好像用proteinworshop可以看

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据

1.预测毕竟是预测,准确率永远不会是100%2.肽段可以既扮演信号肽作用,到了目的地发挥定位锚定作用的.不是绝对的信号肽最终都要被剪切掉的.

我预测蛋白质结构域都是在smart上预测的,是个在线的网站,基本还是蛮准的,另外还有许多网站提供在线预测,不过我只用过smart

结构预测是有意义的,因为通过实验来确定结构仍然要比通过实验确定序列慢得多.结构预测帮助我们理解蛋白质的功能和作用机制,对合理的药物设计也是很有意义的.（理论基础）　　蛋白质结构在进化中要比蛋白质序列保

PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如

预测你的蛋白中的水溶性成分（核/表面比例）：一般分为：e:蛋白表面的氨基酸残基数大于16%b：其他所有残基后面这段是不是一段啊：accessibtypebe%inprotein41.5358.47如果

我可以告诉你,那是不可以能的.一个物种所包含的蛋白质有多少种?NCBI中储存的数据是按照单个蛋白质序列贮存的,而且都只是序列,NCBI不是二级结构数据库,要找二级结构去PDB找,在说了,就算你找到了所

子叶（即两片肥厚的豆瓣）中大豆是双子叶植物,营养物质（比如大量的蛋白质）集中在子叶这个种子结构中

NCBI的ORFFinderhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

这可是个生物信息学大难题,搜搜“同源模建”,一大堆参考资料可以找到.不列举了

将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中

对比同源性一般不是用BLAST,而是用DNAalignment.可以用软件MEGA.有序列了做一个fasta还不容易吗?建一个txt文件,写入下面类似的东西：>yourgenenameandother

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入点右边的protein然后输入你要查的蛋白质在右边有相应物种的,你选择就行,例如如果是人的就是Homosapiens(12)然后就在里面找了

真有叫ABC的结构域呀...在structure里输入("ABC"[PDBDescription])AND"homosapiens"[Organism]试试看是不是你要的.关键词比较多,最好用Adva

你进入Protein的Entrez,用蛋白质AccessionNumber查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样如果没有NC号,就用BLAST搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应