NCBI中在哪里查信号肽
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/28 04:41:20
![NCBI中在哪里查信号肽](/uploads/image/f/717166-46-6.jpg?t=NCBI%E4%B8%AD%E5%9C%A8%E5%93%AA%E9%87%8C%E6%9F%A5%E4%BF%A1%E5%8F%B7%E8%82%BD)
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
Lineage里记录的信息是某个物种的分类地位,即它属于哪个门,哪个纲等等逐级说明.如:人的lineage:cellularorganisms;Eukaryota;Opisthokonta;Metaz
除非你的猪的品种很特别,一般查已知的克隆出来的猪的基因就行了,很保守的出现突变或差异的概率很小,如果是扩这段基因的话直接找一个就行,没多大差异,克隆出来了再去测序就知道不同品种间的差异了.
有一部八几年的《合金钢手册》,里面对合金钢各种元素及特性解释的很清楚.要仅仅查阅化学成分的话建议参考《合金钢钢种速查手册》.
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析比如:
NCBI功能详介和使用方法
找到序列后,ncbi上面靠左一些,屏幕的1/4处,有链接可以直接点.
看看下面的资料,
ncbi中也不是很多吧.那个里面的序列也都是人们提供进去的,有人研究过才有的,不是什么都能查到的百科全书.
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性.对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而且这个编号对应的序列不可更改.这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与
可以试试blast程序,在主页的右上方
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
一般而言,在NCBI(也就是Entrez数据系统)查基因序列,主要是搜索的NCBI的Genbank数据库的核酸与蛋白质序列,方法见六零六406.由于Genbank起初是一个类似BBS的序列数据库系统,
知道了名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能.ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列,从AUG开始,直到终止子
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入点右边的protein然后输入你要查的蛋白质在右边有相应物种的,你选择就行,例如如果是人的就是Homosapiens(12)然后就在里面找了
真有叫ABC的结构域呀...在structure里输入("ABC"[PDBDescription])AND"homosapiens"[Organism]试试看是不是你要的.关键词比较多,最好用Adva
在前面的框里选gene,后面输入金黄色葡萄球菌的英文名和glucan,然后go,就可以了