测序结果上传NCBI比对

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看

用contig1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Maxident均为96%.

有影响,因为热电偶是依靠热电感应产生的热电势进行测温的,而热电势与温度的对应关系表是以冰点为参考点的,冷端温度变化意味着基准参考点电势的变化,因此会对测量结果产生影响.如果冷端参考点高于0°,则测得值

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一

你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.

不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个

1）输入fasta格式序列2）选择核算比对

1.先看下PCR电泳图里杂带多不多,若有的话很可能非特异性扩增了2.若条带干净,仍然有可能存在非特异性扩增,引物特异性不高导致竞争结合可将DNA直接酶切看是否能切出你的目标片段3.序列比对结果不能只看

NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/

你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链（即你目的基因的编码链的互补序列）,而NCBI中提交的序

动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?

首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是

直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分

原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时

NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html

+号表示的是相似性质的氨基酸残基.

一般上面的时间是序列提交到NCBI上面的时间比如你搜索Escherichiacoli吧在genomes里面会出现：1Genome:genomesequencingprojectsbyorganism点

选核苷酸那个nucleotide在basicblast里面再问：请问是nucleotidecollection，选择这个对吗？还有blast之后，要建树嘛，怎么选择同源性菌株呢？再答：嗯对的建树时同源

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

可以用好多软件啊,像DNAman之类的好多啊.